Profile wolnokrążących mikroRNA do identyfikacji mutacji BRCA1/BRCA2

Zgłoszenie patentowe PCT/US2024/027522

Wynalazek dotyczy diagnostyki molekularnej opartej na panelu 19 wolnokrążących mikroRNA do identyfikacji nosicielstwa mutacji BRCA1/BRCA2 – genów odpowiedzialnych za dziedziczny zespół raka piersi i jajnika (HBOC). Kluczową innowacją jest nieinwazyjny test krwi wykorzystujący specyficzne sygnatury miRNA obecne w surowicy/osoczu do przewidywania ryzyka rozwoju nowotworów BRCA-zależnych. Panel diagnostyczny składa się z 19 sekwencji miRNA (SEQ ID NO 1–19): podstawowy panel 10 miRNA (hsa-let-7b-5p, hsa-miR-17-5p, hsa-miR-19b-3p, hsa-miR-20b-5p, hsa-miR-30d-5p, hsa-miR-139-3p, hsa-miR-182-5p, hsa-miR-320b, hsa-miR-421, hsa-miR-375-3p) + rozszerzony panel 9 miRNA (SEQ ID NO 11–19). Model statystyczny wykorzystuje regresję logistyczną i uczenie maszynowe (SVM, lasy losowe, sieci neuronowe) z technikami redukcji wymiarowości (joint lasso).

• Wyjątkowa skuteczność diagnostyczna – AUC ROC 0,89, dokładność 85,61%, czułość 93,88%, specyficzność 80,72%.
• Rewolucja w badaniach wstępnych – identyfikacja kandydatów do kosztownych testów genetycznych (obecnie tylko 10% z 1 mln nosicieli BRCA w USA zna swój status).
• Uniwersalna stosowalność – skuteczność niezależna od wieku, statusu menopauzalnego, historii raka czy rasy.
• Zaleta biopsji płynnej – prosty test krwi vs inwazyjne procedury, możliwość powtarzania bez ryzyka.
• Opłacalne badania przesiewowe – znacząca redukcja kosztów vs uniwersalne testowanie genetyczne.
• Możliwość wczesnej interwencji – identyfikacja nosicieli przed wystąpieniem objawów umożliwia profilaktyczną ooforektomię/mastektomię.
• Kaskadowe badanie rodzin – zidentyfikowanie jednego nosiciela umożliwia badanie całej rodziny.
• Stabilna platforma biomarkerowa – miRNA w krążeniu są stabilne i odporne na degradację.
• Walidacja globalna – zwalidowane na 6 kohortach międzynarodowych (USA, Polska, Indie).

Zaawansowane badania kliniczne gotowe do wdrożenia. Wieloetapowe badanie na 653 próbkach z 6 międzynarodowych kohort: Brigham and Women’s Hospital (N=87), Dana-Farber Cancer Institute (N=362), University of Pennsylvania (N=132), Pomorski Uniwersytet Medyczny (N=52), Tata Medical Center, Indie (N=20). Metodologia: izolacja RNA z surowicy, sekwencjonowanie RNA (miRBase v22.1), normalizacja danych, analiza ekspresji różnicowej (limma), modelowanie uczenia maszynowego (OmicSelector, 94 podejścia selekcji cech), walidacja krzyżowa (trening N=391, test N=130, walidacja N=132). Z 2621 początkowych miRNA po filtracji wyselekcjonowano 19 kluczowych.

• Badania przesiewowe w POZ – test pierwszej linii dla kobiet bez objawów w gabinetach lekarzy rodzinnych.
• Ginekologia onkologiczna – stratyfikacja ryzyka przed planowaniem zabiegów profilaktycznych.
• Poradnictwo genetyczne – wstępna selekcja przed kosztownymi testami genetycznymi.
• Precyzyjna prewencja – identyfikacja kandydatek do badania MRI piersi i intensywniejszego nadzoru.
• Populacyjne programy przesiewowe – masowe badania w populacjach wysokiego ryzyka.
• Medycyna reprodukcyjna – konsultacje genetyczne przed planowaniem ciąży.
• Onkologia prewencyjna – programy chemoprofilaktyki hormonalnej (tamoksyfen, raloksyfen).
• Wspomaganie decyzji klinicznych – algorytmy wspomagające decyzje o zabiegach profilaktycznych.
• Diagnostyka towarzysząca – selekcja pacjentek do terapii inhibitorami PARP.

@:  sylwia.grzelak@umed.lodz.pl, tel.: 502 447 575